Chương trình đào tạo ngành Hóa dược được xây dựng nhằm trang bị cho sinh viên kiến thức nền tảng về hóa học, dược học, sinh học và công nghệ sản xuất dược phẩm. Trong quá trình học, sinh viên được đào tạo về nghiên cứu, tổng hợp, kiểm nghiệm, phát triển và sản xuất thuốc, đồng thời rèn luyện kỹ năng thực hành trong phòng thí nghiệm và ứng dụng công nghệ hiện đại vào lĩnh vực dược phẩm.
Thông thường, chương trình đào tạo kéo dài 4–5 năm (8–10 học kỳ) với khoảng 130–160 tín chỉ, tùy theo quy định của từng trường đại học.